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电子发烧友网>电子资料下载>电子论文>网络协议论文>如何利用生物复杂网络motif发现的并行算法

如何利用生物复杂网络motif发现的并行算法

2020-07-06 | rar | 0.87 MB | 次下载 | 免费

资料介绍

生物复杂网络 motif发现是一种研究生物网络的重要方法,它基于复杂网络的理论研究,以新的视角来研究生命现象和生命机制,但是在处理较大的网络规模或者需挖掘较大的molⅲ时计算效率低。针对这个问题,在现有串行网络moi发现算法ESU的基础上,提出一种基于消息传递接口(MPI)的并行化ESU算法。该方法在ESU计算过程中优化了节点值以解决节点值依赖问题,并以ESU算法的子图发现策略统计各节点子图数,利用动态规划策略寻找最佳节点分配策略以解决负载不均衡问题。interwetten与威廉的赔率体系 网络数据和真实生物网络数据的实验结果表明,并行化ESU算法优化了节点值依赖问题,实现了基于动态规划的负載均衡策略,其运行时间比串行算法缩短了90%,并且该并行算法对不同类型不同规模的网络都具有较强的适用性,有效地提高了网络 motif发现问题的计算效率。

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