高通量测序威廉希尔官方网站 (High-throughput sequencing)又称“下一代”测序威廉希尔官方网站 (Next-generation“ sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA 分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。
高通量测序威廉希尔官方网站 堪称测序威廉希尔官方网站 发展历程的一个里程碑,该威廉希尔官方网站 可以对数百万个DNA 分子进行同时测序。这使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,因此也称其为深度测序(deepsequencing ) 或下一代测序威廉希尔官方网站 (next generationsequencing,NGS) 。
根据发展历史、影响力、测序原理和威廉希尔官方网站 不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS) 、聚合酶克隆(Polony Sequencing)、454焦磷酸测序(454 pyrosequencing)、Illumina (Solexa) sequencing、ABI SOLiD sequencing、离子半导体测序(Ion semiconductor sequencing)、DNA 纳米球测序(DNA nanoball sequencing)等。
说到高通量测序,相信很多人都跟小编一样都不是特别的了解。今天大家就跟着小编一起来认识一下高通量测序威廉希尔官方网站 原理以及它的应用。高通量测序又被人们称作下一代的测序威廉希尔官方网站 和深度测序,它能够一次对几十万甚至几百万的DNA分子进行序列测定和一般来说的读长较短等这些标志,这也使得它对一个物种的转录和基因的分析有了一个全新的面貌。
一、原理
目前,所说的高通量测序威廉希尔官方网站 主要是指454Lifescience公司、ABI公司和Illumian公司推出的第二代测序威廉希尔官方网站 以及HelicosHeliscopeTM和PacificBiosciences推出的单分子测序威廉希尔官方网站 。相对于传统测序的96道毛细管测序,高通量测序一次实验可以读取40万到400万条序列。读取长度根据平台不同从25bp到450bp,不同的测序平台在一次实验中,可以读取1G到14G不等的碱基数,这样庞大的测序能力是传统测序仪所不能比拟的。
二、威廉希尔官方网站 应用
测序威廉希尔官方网站 推进科学研究的发展。随着第二代测序威廉希尔官方网站 的迅猛发展,科学界也开始越来越多地应用第二代测序威廉希尔官方网站 来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序,获得该物种的参考序列,为后续研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序,在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。在转录组水平上进行全转录组测序,从而开展可变剪接、编码序列单核苷酸多态性等研究;或者进行小分子RNA测序,通过分离特定大小的RNA分子进行测序,从而发现新的microRNA分子。在转录组水平上,与染色质免疫共沉淀和甲基化DNA免疫共沉淀威廉希尔官方网站 相结合,从而检测出与特定转录因子结合的DNA区域和基因组上的甲基化位点。
这边需要特别指出的是第二代测序结合微阵列威廉希尔官方网站 而衍生出来的应用--目标序列捕获测序威廉希尔官方网站 (TargetedResequencing)。这项威廉希尔官方网站 首先利用微阵列威廉希尔官方网站 合成大量寡核苷酸探针,这些寡核苷酸探针能够与基因组上的特定区域互补结合,从而富集到特定区段,然后用第二代测序威廉希尔官方网站 对这些区段进行测序。目前提供序列捕获的厂家有Agilent和Nimblegen,应用最多的是人全外显子组捕获测序。科学家们目前认为外显子组测序比全基因组重测序更有优势,不仅仅是费用较低,更是因为外显子组测序的数据分析计算量较小,与生物学表型结合更为直接。
高通量测序威廉希尔官方网站 的出现可以说是基因研究领域中一个十分具有意义的事件,高通量测序相对于前几代的测序相比来说,有了相当大的进步,并且在价格上也得到了相当大的改善。高通量测序威廉希尔官方网站 以低廉的测序成本实施了对更多其他物种的基因密码的获取。相信在未来的发展中,高通量测序威廉希尔官方网站 只会越来越的完善。小编今天的介绍就到这里了,希望可以为大家带来一定的帮助。
发布评论请先 登录
相关推荐
评论